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Jeju Mokgwana war während der Joseon-Zeit ein Regierungsgebäude, wo der Magistrat von Jejudo politischen und administrativen Angelegenheiten nachging. Es brannte im Jahre 1434 nieder und wurde zwar kurz darauf wieder aufgebaut, dann jedoch während der japanischen Invasion zerstört. Nur der Pavillon Gwandeokjeong blieb erhalten.
Von 1991 bis 1998 wurden viermal Ausgrabungen durchgeführt, um das Gebäude wieder originalgetreu wiederherzustellen. Dabei wurden Standort und Struktur der Gebäude nachvollzogen und die Erkenntnisse aus den Ausgrabungen mit alten Dokumenten und Experteneinschätzungen abgeglichen. Im Dezember 2012 wurde das neu errichtete Regierungsgebäude schließlich der Öffentlichkeit präsentiert.